استان خراسان رضوی از مهمترین قطب‌های کشاورزی و صنایع غذایی كشور به شمار می‌رود به طوری که این صنعت نقش اساسی در اشتغال و اقتصاد استان دارد. از سویی، امنیت غذایی از ضروری­‌ترین نیازهای انسان است و تأمین مقدار كافی با كیفیت و ایمنی مناسب مواد غذایی از دغدغه‌های اصلی جوامع از جمله کشور ما محسوب می‌شود. بر این اساس، فناوری تولید مواد غذایی به یكی از زمینه‌های مهم و پیشرفته تحقیق و پژوهش در جهان امروز تبدیل شده است. بنابراین جهاددانشگاهی خراسان رضوی از سال 1369 فعالیت خود را در زمینه پژوهش‌های کاربردی صنایع غذایی در قالب گروه کشاورزی آغاز کرد. با توسعه این فعالیت‌ها و تاسیس سه گروه پژوهشی فرآوری مواد غذایی، کیفیت و ایمنی مواد غذایی و افزودنی‌های غذایی، پژوهشکده علوم و فناوری مواد غذایی جهاددانشگاهی در سال 1386 تاسیس و موافقت قطعی آن از جهاددانشگاهی و وزارت علوم، تحقیقات و فناوری اخذ گردید. این پژوهشکده در حال حاضر مرکز اصلی فعالیت‌های پژوهشی صنایع غذایی در سازمان جهاددانشگاهی است.